Có rất nhiều qui trình bệnh cầu trùng được áp dụng ở nhiều nơi, mức độ thành công của mỗi qui trình phụ thuộc vào điều kiện thực tế của từng trại, từng vùng khí hậu khác nhau và chi phí cho mỗi qui trình cũng khác nhau. Tuy nhiên, muốn khống chế được bệnh cầu trùng thì đòi hỏi người chăn nuôi cần quan tâm đến 2 yếu tố chính:

          Môi trường chăn nuôi: các noãn nang của cầu trùng (hay còn gọi là trứng cầu trùng) sau khi theo phân gà ra ngoài sẽ tồn tại rất lâu trong môi trường, nhất là đối với những nơi ẩm thấp, hầu hết các thuốc sát trùng điều không có tác dụng diệt các noãn nang, sẽ nhiễm vào đường ruột để phát triển và gây bệnh. Như vậy, chất độn chuồng, phân và những chất thải khác là nơi chứa rất nhiều mầm bệnh cầu trùng, chuồng trại nuôi càng lâu năm thì số lượng mầm bệnh cầu trùng càng nhiều thêm. Do đó việc dọn sạch chất thải, xử lý tốt chất thải sau mỗi đợt nuôi sẽ giúp giảm bớt lượng cầu trùng có trong trại.

          Sử dụng thuốc chống cầu trùng: việc sử dụng thuốc định kỳ hoặc thường xuyên để diệt cầu trùng trong cơ thể gà sẽ góp phần quan trọng trong việc phòng trị bệnh.

Qui trình cụ thể như sau:

        Qui trình phòng bệnh:

Đối với những trại trước đây đã thường xảy ra bệnh cầu trùng. Trộn thuốc Cygro với liều lượng 50 gram /100 kg thức ăn. Cho gà thịt ăn liên tục từ 5 ngày tuổi đến trước khi xuất bán 10 ngày và ho gà đẻ ăn liên tục từ 5 ngày tuổi đến 12 tuần tuổi.

Đối với những trại ít xảy ra cầu trùng: Trộn thuốc Cygro với liều lượng 50 gram/100 kg thức ăn. Mỗi tháng cho thức ăn 2 đợt, mỗi đợt 5 ngày cho cả gà thịt và gà đẻ, áp dụng đến trước khi bán thịt 10 ngày hoặc trước khi đẻ 1 tháng.

        Qui trình trị bệnh:

Có rất nhiều loại thuốc có khả năng diệt được cầu trùng ở giai đoạn trưởng thành (chu kỳ sống của cầu trùng phải trải qua nhiều giai đoạn phát triển bên trong tế bào ruột gà), còn những giai đoạn khác thì hầu như có rất ít thuốc có tác dụng tốt. Như vậy, nếu không diệt được giai đoạn sinh sản của cầu trùng thì bệnh rất dễ tái nhiễm và hầu như sẽ luôn tồn tại trong trại. Hiện nay thuốc Baycox của Bayer có khả năng diệt được tất cả những giai đoạn phát triển của cầu trùng trong cơ thể của gà với liều lượng 1 cc Baycox / 3,5 kg gà / ngày, sử dụng 2 ngày liên tục. Trong quá trình điều trị cần bổ sung thêm men tiêu hoá Acid-Pak4-Way và Multivitamin AT12.