Đây là nội dung được quy định tại Thông tư 171/2016/TT-BTC do Bộ tài chính ban hành ngày 27/10/2016. Theo đó:

Mức thu lệ phí cấp giấy phép quy hoạch vẫn giữ nguyên mức 2.000.000 đồng/01 giấy phép.
 Tổ chức thu lệ phí thực hiện kê khai lệ phí theo tháng và quyết toán lệ phí theo năm theo quy định tại khoản 3 Điều 19 Thông tư 156/2013/TT-BTC .

Tổ chức thu lệ phí phải nộp toàn bộ số tiền lệ phí thu được vào ngân sách nhà nước thay vì được trích lại 10% trên tổng số lệ phí thu được như hiện nay.

Thông tư 171/2016/TT-BTC có hiệu lực từ ngày 01/01/2017 và thay thế Thông tư 23/2012/TT-BTC.